Judecând în cadre strâmte, capii Bisericii aruncă asupra indezirabililor acuzaţia infamantă de apărători ai cauzei marxismului. Leonardo Boff a cunoscut tracasările administrative şi teroarea spirituală exercitată de Congregaţia pentru Doctrina Credinţei, Inchiziţia rebotezată. Teologul Boff, prin studiile sale (peste 120), a dezminţit ante factum acuzaţiile cardinalului Ratzinger. Care a fost ridiculizat pentru orbire şi interpretări fără suport faptic. Lipsit de subtilitate şi de simţul discriminării nuanţelor, Ratzinger fie a citit în zig-zag analizele social-teologice ale lui Boff, fie a citit doar rezumate redactate de secretarul particular. Leonardo Boff a denunţat încă în scrierile timpurii monstruozitatea birocratică a marxismului şi strangularea libertăţilor individuale. O eroarea majoră semnalată de Boff este confuzia între socialism şi marxism. Socialismul nu înseamnă marxism, după cum nici creştinismul nu înseamnă inchiziţie. Ambele, marxismul şi inchiziţia, fiind devieri groteşti. (n.n. - Nici Lenin nu a fost marxist. A atenuat efectele foametei împărţind pământ mujicilor care n-au fost proprietari. Niciun ţăran rus n-a rămas fără un lot. Iar electrificarea imperiului a fost contractată companiei americane General Electric. Noua Politică Economică - NEP - a dus la smulgerea Rusiei din Evul Mediu.)

ÃŽn 1981, Leonardo Boff a publicat “scandaloasa” lucrare “Biserica: charismă ÅŸi putere”, în care arată că exercitarea excesivă a puterii de către instituÅ£ia Bisericii prejudiciază charisma ÅŸi subminează credibilitatea creÅŸtinismului. De la Martin Luther, nimeni n-a mai pus în discuÅ£ie autoritatea ecleziastică a Bisericii, ierarhia acesteia, stilul de exercitare a puterii, tradiÅ£ia de intoleranţă ÅŸi dogmatism, reprimarea criticilor provenite din interior şi interdicÅ£ia dreptului de a gândi. Idealul socialist - sublinia Boff - poate lua ÅŸi alte forme istorice decât cele aplicate în Estul Europei, în Cuba, în China, în Coreea de Nord, în Mongolia. (n.n. - în China mai suravieÅ£uieÅŸte doar sistemul politic comunist-maoist, în timp ce drepturile economice au fost restabilite.)

Boff a fost pedepsit pentru că a îndrăznit să-şi exprime convingerile. I-a fost impus 1 an de tăcere penitentă (i-a fost luat dreptul de a predica şi de a publica) în urma convocării la Vatican (1984), unde a avut o discuţie furtunoasă cu actualul papă, Benedict al XVI-lea. În 1985 sancţiunea a intrat în vigoare. În cele din urmă a întors spatele Vaticanului şi a părăsit Ordinul franciscanilor, continuând să se dedice activităţilor umanitare şi didactice.